Koncertna dvorana Blagoje Bersa središnja je dvorana zgrade Muzičke akademije otvorena u siječnju 2016. godine. Osim što je središte pedagoškog rada Muzičke akademije, prepoznatljivo je mjesto zagrebačkog kulturnog i umjetničkog života.

U Koncertnoj dvorani Blagoje Bersa održavaju se tri redovita koncertna ciklusa Muzičke akademije: Vivat academia, Vivant professores and Virtuoso.

Muzička akademija ima dugogodišnju suradnju s mnogim uglednim institucijama i ansamblima u Hrvatskoj. Osim u prostorijama Muzičke akademije, studenti često nastupaju i na brojnim drugim lokacijama, poput Koncertne dvorane Vatroslava Lisinskog, zatim dvorane Hrvatskog glazbenog zavoda, u Hrvatskom narodnom kazalištu, kazalištu „Komedija“ i Mala scena, u Muzeju Mimara i Europskom domu, različitim zagrebačkim crkvama, ali i izvan Zagreba pa i preko granica Republike Hrvatske.

Od izvedbe Njemačkog rekvijema Johannesa Brahmsa u Koncertnoj dvorani Vatroslava Lisinskog pod ravnanjem dirigenta Vladimira Kranjčevića 1983. godine, Muzička je akademija dvaput u sezoni redoviti gost koncertnog ciklusa Lisinski subotom. Svake godine najbolji studenti Muzičke akademije imaju prilike nastupiti sa Zagrebačkom filharmonijom i Zagrebačkim solistima. Muzička akademija i Zagrebačka filharmonija svake godine poklanjaju studentima, pretplatnicima Zagrebačke filharmonije i građanima Grada Zagreba Koncert na dar. S diplomantima Muzičke akademije također povremeno nastupa Simfonijski orkestar HRT-a te izvodi djela studenata kompozicije.

Produkcija opere Ljubavni napitak Gaetana Donizettija u Hrvatskom narodnom kazalištu 2008. godine ostvarena u suradnji dirigenta Zorana Juranića i redateljice Dore Ruždjak Podolski, potaknula je redovitu projektnu suradnju između umjetničkih sastavnica Sveučilišta u Zagrebu. Od izvedbe Mozartove opere Čarobna frula 2009. godine svake godine na zajedničkom opernom projektu surađuju studenti Muzičke akademije, Akademije dramske umjetnosti, Akademije likovnih umjetnosti i Tekstilno-tehnološkog fakulteta, uz povremeno sudjelovanje Studija dizajna pri Arhitektonskom fakultetu. Iz te su suradnje proizašli mnogi uspješni operni projekti kao što su primjerice Orfej Christopha Willibalda Glucka, Madame Buffault Borisa Papandopula, Cosi fan tutte Wolfganga Amadeusa Mozarta, Agrippina Georga Friedricha Händela, Lukava mala lisica Leoša Janáčeka, Pepeljuga Julesa Masseneta, Animal Farm Igora Kuljerića, Amfitrion Borisa Papandopula itd.